Попробую последовательно ответить на все.

1. Все равно смысла не вижу. Реальный износ винта можно определить только на специализированных комплексах. Почему? Пожалуйста посмотри
http://www.imho.ws/showthread.php?t=99979
я в конце отписался суммарно. И не только о размерах.
И в результате мы что имеем? То, что пройдя некоторые процедуры, винт будет еще достаточно долгое время работоспособен.
Реально достаточно в общем и целом:
-картинки СМАРТа от hdd-911. причем там все видно сразу и четко. Плюс система выдаст статус. Будет ясно, были ли ремапы, сколько их еще доступно, количество запусков винта скажет о жизни его по питанию-работе...и прочая и прочая
-теста поверхности от mhdd. У новых винтов даже зеленыши не особо приветствуются, а вот красные оттенки и БЭДы говорят сами за себя
-акустической проверки на звук вращающегося шпинделя. Если звенит або что-плохо, винт либо перенес удар, либо начинает вырабатываться подшипник оси....

2. Да, и давно. активируется при простое винта энное время с питанием и без нагрузки. В общем иногда даже рекомсендуют подать на винт питание и дать ему часов несколько погудеть. Эта технология в базе своей опирается на селфтесты винта, и помня логи СМАРТа и кое-что там еще свое ведет анализ секторов, дополнительно тестируя проблематичные и убирая их с заменой на здоровые из резерва с переносом данных ДО конечного формирования БЭДа. Так что появившиеся после энного времени работы ремапы говорят о здоровье винта. Поглядывай за ростом-и будет тебе счастье.

3. А в какой ситуации идет вибрация? Приработе или даже при простое?
У меня САТАшный вестерн вибрирует при работе, но не так дико, как говоришь.
Если звук постоянный-писал выше, если при работе.....
попробуй снять образ винта, чтобы не потерять данные, в mhdd дать команду erase, дождаться ее завершения....долгий процесс...а потом вернуть образ на место. Этим мы попробуем избавиться от нестабильностей в областях загрузочных записей и размещения ФС.
Ну и дефрагментация....
А насчет ALM.... если она поддерживается производителем, то соответствующей командой в mhdd или hdd-911 ее можно изменить.

К посту Yraman маленькая поправка к п 3. Команда ИМХО aerase.

hdd-911 это Victoria ?
И что делать если smart переполнился ?

То есть СМАРТ переполнился? Чуть подробнее. А на вопрос-да, это Виктория