[PANpredator]

Если это сообщение появилось после некорректного выключения компьютера, нужно просто, после загрузки Виндуса самостоятельно запустить "Скан Диск" или "Чекк Диск" и проверить все имеющиеся диски.

В первом варианте нужно открыть папку "My computer" и правой мышой выбрать пункт меню "Properties", в открывшемся окне выбрать закладку "Tools" и нажать в верхней части кнопку "Check Now..."

Во втором варианте для каждого диска выолнить комманду:
chkdsk c: /F

После любого из вариантов Винда, по идее, должна отказаться от проверке дисков при загрузке системы. Если не поможет - нужно тогда проверять автозагрузку (и в реестре тоже) или планировщик задач.

А если вообще, переход на NTFS - избавляет от появления потерянных клястеров и проверка диска, после некорректного выключения компьютера, не происходит.