[Fermata]

ExtinctSun, aazman

А от кого вы хотите эти файлы защитить? От кулхацкера не спрячете, а вот от обычного юзера вполне можно. Только файл должен быть не просто скачан, а проинсталирован. Тогда появятся варианты.
Например, можно заставить винду считать этот файл системным и она не позволит его стереть или переименовать. Но надо хорошо разбираться в реестре, чтобы перехитрить систему (у меня не спрашивайте, я не разбираюсь).
Проще всего сделать так, чтобы инсталятор ставил в автозагрузку малюсенький ЕХЕшник, который в фоновом режиме обращался бы к защищаемому файлу. Тогда при попытке изменить/удалить появится окно, что файл занят другой программой. Вот я бы так и сделала, если бы сильно припекло.
Но всё это спасёт только от ламеров.
Для защиты авторских прав это тоже бесполезно.