Была схожая проблема, только не с Логитеховским джойстиком, а с Сайтеком. Не хватало питания по юсб, джой то отключался во время работы, то при загрузке определялся как неизвестное устройство. Вылечилось покупкой вот такой копеечной штуки
http://www.nix.ru/autocatalog/contro...ext_33977.html