На диске информационно-технологического сопровождения фирмы 1С рекомендаций по выбору ОС Linux нет, но 2 раза встречается упоминание
Fedora Core 4.
Думаю, что можно взять свежую
Fedora 9 и не париться.
На форуме партнёров 1С некоторые партнёры работают с
Linux CentOS.