Подскажите, есть ли у Lingvo X3 параметры запуска приложения? К примеру
C:\Pro...\Lingvo.exe /minimize 
- что бы лингво при загрузке пряталось в трей. Лингво агент - не подходит, так как его запуска мало для включения опции "Перевод по Ctrl + наведение курсора мыши".