Все таки стоило опыты с железом начинать с замены БП
А то при таких алгоритмах проверки он спокойно может забрать на тот свет пару материнок и еще кучу железок...
Теперь по вопросу чистки компа...предположений почему карточка отказалась работать в старом слоте у меня нет, может быть что угодно, слишком мало исходных данных.
Второе: весьма вероятно, что материнская плата включается через 2 секунды, чтобы дать БП сначала раскрутить винты, тем самым снизив нагрузку на него, в спецификации это должно быть описано, быть может это можно отключить в БИОСе, но не стоит.
Методика проверки БП методом перетыка винчестеров может и не сработать, если на нем стоит защита от разрывов питания.
Если же проблема в том, что БП не может завести два харда одновременно, значит, вечная память ему.
Теперь к проблеме: уточните, видеокарта включается только когда она холодная, а после перезагрузки не работает или теперь она вообще не включается?
Да, попробуйте почистить контакты на видеокарточке обыкновенным ластиком.