[Borland]

FAR Manager, к примеру.
В нём есть такая удобная штука, как "Временная панель".
Отобранные файлы/папки "копируются" во временную панель (процесс практически мгновенный, ибо по факту как раз и происходит составление списка, а не копирование), а потом из временной панели (фактически - из мест оригинального расположения) копируется всё скопом в заданную реальную папку.
При этом главное чтобы в списке не было элементов с повторяющимися именами - ибо возникает конфликт имён и программа настойчиво интересуется: "Файл уже существует в папке назначения. Переписать или пропустить копирование?" и ждёт вмешательства пользователя (несколько папок с одинаковыми именами просто копируются в одну, если внутри них нет повторяющихся имён файлов). Файлы из списка копируются в корень папки назначения, безотносительно путей, папки - со всем содержимым.
Подозреваю, что аналогичный функционал есть и в Total Commander, а также не исключено его наличие и в других файл-менеджерах.