[kolchanov]

Pinky,
Добавлю и свои пять копеек. У нас тоже NAS Synology c дисками WD RED. Подключен к роутеру через патч код, далее по wi-fi. У нас 412, четырехдисковый.

Вы пробовали мониторить - насколько загружен NAS когда он "тормозит" - процессор и жесткие диски?

Какие у вас сервисы запущены в DiskStation Manager?
В принципе так как используется файловая система EXT4 а не FAT, то они не считают дефрагментацию проблемой :
hXXps://www.synology.com/en-us/knowledgebase/faq/212

Возможно Вам просто нужно обновить файловую систему на используемых дисках. У нас никаких проблем на 2-х летке нет, используем 2x3TB + 2x6TB RAID 0.

Попробуйте подключиться непосредственно к NAS через и покопировать. Заодно и поймете насколько влияет wifi на скорость соединения.