По роду деятельности часто приходится сводить воедино или сравнивать несколько файлов - лучше программы для этого не видел.
Лежит по адресу
http://www.araxis.com/merge, называется Araxis Merge. Не бесплатна, но выход из положения найти можно
Из особенностей:
- Позволяет сравнивать каталоги
Позволяет сравнивать файлы
Показывает новое/измененное/удаленное
Позволяет сравнивать 2 или 3 (!) файла
Позволяет тут же, "не отходя от кассы", скопировать/заменить/удалить различающиеся участки
Позволяет редактировать
Понимает Unicode
Если поместить на панель TotalCommander и указать стартовые параметры как %P%N %T%M, сравнивает файлы/каталоги на левой и правой панели
Наверняка есть еще что-то, но это то, чем активно пользуюсь.
В общем, рекомендую.