ну что же. по прошествии трех лет можно констатировать, что ясности в этом вопросе не прибавилось. проблема майкрософтового api дефрагментации все также замалчивается всеми производителями. более того, есть мнение что никакой проблемы и не существует - проблема надумана. нечто похожее произошло со службой QoS, когда все разом бросились ее отключать, а некоторые даже "своими глазами видели прирост скорости".
по сей день speeddisk остается единственным дефрагментатором, игнорирующим стандартный api win2k. именно по этой причине symantec забросил его поддержку и дальнейшую разработку - получить сертификат microsoft на такой продукт просто невозможно... по этой же причине все коммерческие продукты используют стандартный api...
по заверениям microsoft в xp стандартный api дефрагментации избавлен от всех недостатков, присущих api в win2k...