[Zhiberya]

Home directory: e:\ftp\pub
и хочешь дать доступ к e:\ftp\upload

Именно так!
Нужно и прописать виртуальную папку и убрать галку "Блакировать пользователя в домашнем каталоге". Иначе, по крайней мере у меня, работать не будет.