DOLPHIN_NV, всё тот же NTFSDOS Pro от Winternals можно использовать. Если прописать в autoexec'е монтирование дисков, то ты будешь видеть их и в винде.
А если в сеансе MS-DOS, то только в окне этого сеанса.
Плюс ещё есть некоторые утилиты именно для Windows98, но эта проверена временем, так сказать
