странная проблема.. поставь просто уже настроенную "триаду" - есть несколько готовых, рабочих и проверенных вариантов:
http://sourceforge.net/projects/phptriad/ (к этому еще идет огромное количество "притертого" софта там же на соусфорже)
http://sourceforge.net/projects/webserv/ Containting apache2, mysql, activeperl, mod_perl, php, adodb, awstats, phpmyadmin, smarty, turck-mmcache packaged into a nice installer (WAMP). - куча полезного хлама в одном флаконе
http://sourceforge.net/projects/miniserver/
2.5Mb only. It includes latest versions of Apache2, Perl5, PHP4, MySQL4, phpMyAdmin,...
все три точно работают....
А вообще, дело в том что с определенной версии PHP сменил встроенную поддержку MySQL на более корректный способ - использование родной mysql библиотеки. Естественно, при этом часть функций и софт написанный "в старом стиле" получил проблемы.. боюсь у тебя именно в этом дело, а не в несовместимости между php и мускулом. посмотри внимательно где и почему падает сервер, посмотри логи мускула и логи сервера, думаю сразу разберешься.
Удачи!
-- л
http://minivan.ru