Я тоже немного с этим вопросом сталкивался.
Type-1 - это родной формат, в котором пишут камкодеры и большие DV камеры. Также с ним работает большинство студийной аппаратуры, в частности профессиональные DV рекордеры (сам с таким работал). Короче, если хочется смотреть с камкодера или давать на студию в эфир

, то однозначно только Type-1.
Type -2 разработал чуть ли не Микрософт, если мне не изменяет память. Его преимущества только в том, что при редактировании на компьютере, если меняешь только один звук, видео поток остается неизменным и не пересчитывается, поскольку аудио и видео потоки разделены. То есть экономятся ресурсы машины. С другой стороны, если редактировать и аудио и видео, никаких преимуществ нет, все равно рендериться будут оба потока.
Поэтому я однозначно рекомендую использовать Type-1 как наиболее совместимый (WFW не в счет

).