[Mg0]

Я ситуацию понимаю так: у тебя дома стоит комп со 120 Gb хардом. Всё работает.
На работе у тебя другой комп. Там есть какой-то загрузочный хард и 80-ка и тоже все работает. Ты отцепляешь там 80-ку, приносишь ее домой, прицепляешь к своему -- и ничего не заводится. Так? Если не так, то поправь.

Навскидку приходит в голову:
1. Проблемы с питанием (не хватает мощности блока, дефектный молекс и т.п.)
2. Конфликт по адресации шины (мастер/слейв). Попробуй отцепить CD-ROMы и т.п. и оставить на 1-м канале 120-ку, а на 2-м -- 80-ку.
3. Кривой канал IDE контроллера. Посади оба диска на один канал, сделав 120-ку мастером, а 80-ку -- слейвом.
4. Наличие файловой системы вообще и ее тип в частности на 2-м диске не должны оказывать никакого влияния на загрузку.