Если вопрос актуален, то попытаться можно ERD Commander-ом сделать откат при условии, что имеются контрольные точки восстановления. ERD Commander имеется на Live CD, к примеру, от Филки.
Ну, и не юзать TuneUp
Как альтернативу предлагаю пользовать jv16 PowerTools с твикером (опять же к примеру) XP Tweaker или Tweak-XP Pro, если руками никак.