Любая ОС Windows в изначальном состоянии (т.е. сразу после установки с оригинального дистрибутива от M$) не содержит никаких антивирусных/антикряковых функций в принципе и не удаляет никаких файлов без специальной команды.
Да, могут возникать
проблемы с доступом к файлам на NTFS-разделе, оставшимся от предыдущей установки. Но, повторюсь - проблемы с доступом, операционкой ничего само по себе
не удаляется. Никогда.